В 1984 г. окончил технический ВУЗ. В 1987-1988 годах проходил стажировку на киностудии Ленфильм в киношколе Сокурова. В 1991 году на Ленфильме снял полнометражный дебют - «Папа, Умер дед Мороз», получивший Гран-при на кинофестивале в Римини (Италия). В последующие годы на киностудиях «СТВ» и «Никола-Фильм» снял четыре полнометражных кинофильма. Эти работы были показаны на ведущих международных кинофестивалях. В 2005 году на Роттердамском кинофестивале был избран режиссером в фокусе и представил полную ретроспективу своих фильмов.
Работы Евгения Юфита находятся в коллекциях Государственного Русского Музея, Нидерландского Киномузея, Музея Современного Искусства в Нью-Йорке (МОМА).